Identifikasi Gen Pengkode Enzim Termostabil dengan Pendekatan Metagenom

Abstract

Pada tugas akhir ini telah dilakukan penelitian tentang identifikasi gen pengkode enzim termostabil dengan pendekatan metagenom. Penelitian tersebut bertujuan untuk mendapatkan informasi mengenai gen pengkode enzim termostabil, mengetahui homologi urutan asam amino dan hubungan kekerabatan menggunakan pohon filogenetik. Selain itu, tujuan lain dari penelitian ini yaitu mengetahui perbedaan asam amino antara sampel dengan gen mikroba lain. Hasil visualiasasi gel agarosa didapatkan gen dengan ukuran 1400 bp. Penentuan urutan nukelotida dan analisis homologi menggunakan program BLAST menunjukkan ketiga isolat memiliki kemiripan dengan gen pengkode NADP-dependent glyceraldehyde-3 phosphate dehydrogenase sebesar 74.34%. Selanjutnya dengan gen pengkode MFS transporter sebesar 86.91% serta gen pengkode Thiaminase II sebesar 87.91%. Hasil konstruksi pohon filogenetik didapatkan adanya hubungan kekerabatan atau hubungan filogeni antara sampel dengan homologi tertinggi. Gen pengkode enzim termostabil yang diperoleh memiliki perbedaan asam amino dengan protein yang memiliki homologi tertinggi pada GeneBank.